بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های Sclerotinia sclerotiorum با استفاده از نشانگر *rep-PCR

بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه کلزا ناشی از Sclerotinia sclerotiorum یکی از مهم‌ترین بیماری‌های قارچی کلزا در ایران می‌باشد. با توجه به اهمیت این بیماری و عدم وجود اطلاعات کامل از ساختار ژنتیکی جمعیت‌های این قارچ گروه‌های سازگاری میسلیومی و تنوع ژنتیکی بین و درون گروه‌های سازگاری میسلیومی (mycelial compatibility grouping, MCG) شناسایی شده از سه استان گلستان، مازندران و آذربایجان غربی بررسی شد. تعداد 64 جدایه با توجه به پراکنش جغرافیایی انتخاب و MCG آنها تعیین گردید. در بین این تعداد جدایه، 42 گروه سازگاری میسلیومی شناسایی شد. آزمون‌های بررسی قدرت  بیماری‌زایی (ویرولانس) جدایه‌ها در گلخانه انجام گرفت. تجزیه و تحلیل داده‌های حاصل از ترکیب سه شاخص یادداشت برداری فنوتیپ زخم، طول زخم و درصد توسعه زخم دور ساقه جدایه‌ها را به سه گروه با قدرت  بیماری‌زایی مختلف تقسیم نمود. نتایج این مطالعات نشان داد که قدرت  بیماری‌زایی جدایه‌های درون یک MCG و نیز بین MCG‌ ها متفاوت بود. در بررسی تنوع ژنتیکی بین  MCG‌ها (38 جدایه نماینده سی و هشت MCG)، بر اساس تجزیه و تحلیل الگوهای باندی حاصل از مجموع چهار آغازگر rep-PCR در سطح تشابه 64 درصد جدایه‌ها در هفت گروه قرار گرفتند. بر این مبنا، بیشتر جدایه‌ها از لحاظ منشا جغرافیایی از یکدیگر تفکیک شدند. قدرت تمایز بالای این نشانگر (993/0 = D) در تمایز 38 جدایه به 37 ژنوتیپ نشان داد که می‌توان از rep-PCR به‌عنوان یک روش مفید و سریع برای بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های S. sclerotiorum استفاده کرد.